Программа "От генома к мишени" (автоматизированная конвейерная система "От генома к мишени" или Геномный усилитель) открыто лицензируется ООО "БИОСОФТ.РУ" на основе простых неисключительных пользовательских лицензий.

Программа позволяет проводить полностью автоматизированный анализ геномных,  транскриптомных, эпигеномных, метаболомных и протеомных данных человека и производить реконструкцию молекулярного механизма изучаемого процесса или патологии на основании интегрированного анализа генной регуляции и внутриклеточных сигнальных путей.

Программа лицензируется путем предоставления онлайн доступа к системе. Облачное хранилище для хранения и обработки омиксных данных является интегральной частью лицензии и по умолчанию предосталяет проект размером 100 Гб на 1 пользователя (1 лицензия).

Срок действия стандартной лицензии – 12 месяцев с даты активации.   

Ключевыми особенностями системы являются:  

- Загрузка и хранение омиксных данных в следующих форматах:  

Транскриптомные данные:  

- RNA-seq, микрочипы: *.txt, *.csv, *.xls (таблица с идентификаторами генов)  

- CEL (affymetrix)  

- *.txt (special agilent format)  

- *.txt (special illumina format)

- *.fastq  

Эпигеномные данные (ChIP-seq):  

- *.fastq  

- *.bam (hg38)  

- *.bed (hg38)  

- *.txt (таблица с идентификаторами зондов метилирования cg*)  

Геномные данные:  

- *.vcf  

- *.txt, *.csv, *.xls (табличные данные с идентификаторами rs*), *.tsv  

- *.fastq  

Протеомные данные:  

*.txt, *.csv, *.xls (таблица с идентификаторами белков)  

Метаболомные данные:  *.txt, *.csv, *.xls (таблица с идентификаторами метаболитов из БД chebi формата: CHEBI:57316)  

 - Полностью автоматизированная статистическая обработка экспериментальных транскриптомных, протеомных, эпигеномных, геномных и метаболомных данных    

- Полностью автоматизированный поиск генов, характеризующих изучаемый патологический процесс (целевые гены)  

- Полностью автоматизированный поиск комбинаций транскрипционных факторов, регулирующих целевые гены (анализ регуляторных областей целевых генов)    

- Полностью автоматизированный анализ сигнальных путей с поиском мастер-регуляторов изучаемого патологического процесса    

- Полностью автоматизированный поиск перспективных терапевтических мишеней и лекарственных препаратов для воздействия на изучаемый патологический процесс  

- Генерация отчета о выполненном анализе    

Технические требования по совместимости программного обеспечения:  Веб-браузеры: Mozilla Firefox версии 2.0 и выше, Chrome, Opera, Safari.